More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0459 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  83.1 
 
 
441 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  87.27 
 
 
441 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  82.75 
 
 
458 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  82.99 
 
 
446 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.28 
 
 
454 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.41 
 
 
447 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.53 
 
 
448 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.35 
 
 
446 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.5 
 
 
442 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  79.26 
 
 
444 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.45 
 
 
442 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.69 
 
 
441 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.53 
 
 
447 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.53 
 
 
447 aa  730    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.3 
 
 
441 aa  713    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.37 
 
 
442 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 
444 aa  904    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.58 
 
 
442 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  87.27 
 
 
445 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  85.81 
 
 
442 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  81.55 
 
 
446 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.81 
 
 
446 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  82.48 
 
 
447 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.5 
 
 
442 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  81.55 
 
 
446 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  84.49 
 
 
440 aa  689    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  81.55 
 
 
446 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  87.73 
 
 
444 aa  746    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.59 
 
 
455 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.95 
 
 
460 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.11 
 
 
456 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.3 
 
 
448 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  38.31 
 
 
529 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.59 
 
 
496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.32 
 
 
492 aa  236  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.25 
 
 
535 aa  232  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  35.76 
 
 
518 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  36.71 
 
 
497 aa  230  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.39 
 
 
503 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.89 
 
 
529 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  35.89 
 
 
529 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  36.71 
 
 
530 aa  223  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  34.77 
 
 
510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.55 
 
 
510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  34.55 
 
 
510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  35.24 
 
 
505 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.97 
 
 
545 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  34.41 
 
 
503 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.43 
 
 
502 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.6 
 
 
516 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.03 
 
 
516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  39.31 
 
 
502 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.84 
 
 
516 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  40.41 
 
 
507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  33.56 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  40.41 
 
 
507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.41 
 
 
501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  34.43 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  35.25 
 
 
502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.27 
 
 
502 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.57 
 
 
514 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.1 
 
 
510 aa  209  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  33.89 
 
 
507 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
502 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  33.41 
 
 
500 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  32.48 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  33.56 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  33.56 
 
 
500 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  33.65 
 
 
507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.89 
 
 
507 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.04 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  34.65 
 
 
501 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  35.67 
 
 
509 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.91 
 
 
546 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.95 
 
 
510 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  35.06 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.67 
 
 
509 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.93 
 
 
547 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.02 
 
 
440 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.89 
 
 
466 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
741 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.53 
 
 
712 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.52 
 
 
453 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.39 
 
 
520 aa  159  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.72 
 
 
507 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  32.51 
 
 
747 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.58 
 
 
472 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.78 
 
 
693 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  33.88 
 
 
437 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  33.42 
 
 
685 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  30.66 
 
 
539 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.79 
 
 
526 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  34.86 
 
 
681 aa  150  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  34.06 
 
 
684 aa  149  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.34 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.34 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.34 
 
 
496 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  31.18 
 
 
511 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.36 
 
 
581 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>