More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2501 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.35 
 
 		 455 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 		 460 aa  953    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75.51 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.58 
 
 		 448 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.45 
 
 		 441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.86 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.09 
 
 		 448 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.86 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.14 
 
 		 447 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  71.76 
 
 		 441 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.29 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.29 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.29 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  70.41 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.34 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.85 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.95 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.71 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.95 
 
 		 444 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.79 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  69.02 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.12 
 
 		 458 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.23 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  68.41 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.18 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  69 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.63 
 
 		 442 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.86 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.3 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.53 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  70.12 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  67.27 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.75 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.05 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.41 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.56 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.5 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  35.66 
 
 		 529 aa  232  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  35.07 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  34.62 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.06 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  33.41 
 
 		 500 aa  229  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.01 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.43 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  32.49 
 
 		 530 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  33.71 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  32.56 
 
 		 507 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  33.71 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.77 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  32.01 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  32.95 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  32.48 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.59 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  32.02 
 
 		 503 aa  224  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  33.11 
 
 		 507 aa  223  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  33.11 
 
 		 507 aa  223  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.54 
 
 		 516 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  31.71 
 
 		 502 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  32.11 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.57 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.11 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.02 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.51 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.6 
 
 		 535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  29.96 
 
 		 510 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  31.49 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  31.65 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  34.68 
 
 		 529 aa  216  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  32.81 
 
 		 497 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  33.18 
 
 		 501 aa  216  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.86 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.4 
 
 		 466 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.78 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.67 
 
 		 546 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  31 
 
 		 509 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.09 
 
 		 547 aa  206  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.13 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.84 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  30.02 
 
 		 509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.33 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.41 
 
 		 472 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  29.66 
 
 		 747 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.46 
 
 		 693 aa  163  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.82 
 
 		 712 aa  162  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.93 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.69 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  31.2 
 
 		 685 aa  156  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  31.49 
 
 		 681 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.62 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.09 
 
 		 507 aa  153  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  30.1 
 
 		 741 aa  153  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.07 
 
 		 453 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26 
 
 		 530 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.59 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.96 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  28.21 
 
 		 511 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  28.12 
 
 		 522 aa  149  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.64 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.64 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>