More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6852 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0633  hypothetical protein  34.62 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.182663  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  37.71 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2086  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.39993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1964  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2010  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1944  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.982721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  29.21 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.91 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.79 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  25.9 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  31.55 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  28.18 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  26.7 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 328 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  26.29 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  24.65 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.57 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.79 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 310 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.04 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  25.15 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  25.15 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.86 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  23.94 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  23.94 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.29 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.86 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  33.96 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.85 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  23.94 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  29.41 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  22.78 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.04 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  34.29 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  32 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>