More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1596 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  100 
 
 
217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  47.06 
 
 
214 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  48.51 
 
 
213 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  42.44 
 
 
218 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.77 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2048  hypothetical protein  38.83 
 
 
221 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  37.2 
 
 
207 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1546  generic methyltransferase  40 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
211 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1688  methyltransferase  46.08 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0442  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1468  methyltransferase type 11  37.81 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.197661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0447  methyltransferase type 11  36.87 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  32.55 
 
 
229 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1686  methyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.48 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.48 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
411 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.29 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.01 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.53 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.74 
 
 
386 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.14 
 
 
250 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  31.45 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.52 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.74 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.54 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.46 
 
 
256 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
250 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.74 
 
 
256 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  33.88 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.17 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.74 
 
 
256 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
271 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.42 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.74 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
327 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.42 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.74 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  29.93 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.42 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
254 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2001  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323981  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.68 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.09 
 
 
275 aa  52.4  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.87 
 
 
254 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.05 
 
 
282 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
254 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
252 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.79 
 
 
251 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.79 
 
 
251 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.66 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.04 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  28 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.34 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0633  hypothetical protein  29.7 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.182663  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.95 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>