More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2048 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2048  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  48.31 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  41.33 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.81 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  41.24 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1468  methyltransferase type 11  39.11 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.197661  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1546  generic methyltransferase  37.93 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0442  Methyltransferase type 11  40.89 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1688  methyltransferase  40 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0447  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  35.35 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1686  methyltransferase  33.07 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.62 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.76 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.76 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.76 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 411 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  38.68 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.9 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.48 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.9 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.86 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 1012 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  33.64 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.7 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  39.78 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  31.63 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.57 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.38 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.25 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.45 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  24.75 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  34 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.36 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  35.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.68 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.96 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  35.06 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.29 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.91 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.63 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.14 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  24 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.14 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.27 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  32 
 
 		 347 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  36 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.36 
 
 		 386 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.05 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.02 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  32.41 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.64 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 313 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31705  predicted protein  30.3 
 
 		 163 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.592624  normal  0.0686433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>