More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1686 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1686  methyltransferase  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
218 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  37.89 
 
 
229 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  32.82 
 
 
207 aa  104  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  30.48 
 
 
214 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1468  methyltransferase type 11  32.82 
 
 
207 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.197661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
213 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0447  methyltransferase type 11  35.08 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.05 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1546  generic methyltransferase  37.3 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2048  hypothetical protein  33.07 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0442  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1688  methyltransferase  28.72 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.57 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  40 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
411 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 
254 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  33 
 
 
254 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.98 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.84 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.63 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.04 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  32 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
276 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
355 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
255 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  40.85 
 
 
255 aa  52  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.24 
 
 
307 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.79 
 
 
221 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.67 
 
 
256 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.73 
 
 
250 aa  51.6  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.79 
 
 
221 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.67 
 
 
256 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  27.82 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  26.79 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.79 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.79 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.79 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.67 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  26 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.79 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
271 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.71 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  33.02 
 
 
250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  33.06 
 
 
825 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.03 
 
 
265 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
330 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
262 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.17 
 
 
256 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.17 
 
 
256 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.37 
 
 
260 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.82 
 
 
245 aa  48.5  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
267 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.17 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
242 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
242 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
250 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.25 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.17 
 
 
256 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>