173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0633 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0633  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.182663  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  53.92 
 
 
217 aa  260  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
229 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
217 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  30.62 
 
 
216 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2086  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.39993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
229 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1964  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2010  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1944  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.982721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  24.6 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  22.92 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.27 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
411 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  25.9 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
268 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.85 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  20.14 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  20.14 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  20.14 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  22.75 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
274 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  20.14 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.3 
 
 
207 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
246 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.81 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  28.32 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.63 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  28.46 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.18 
 
 
386 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.23 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.16 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.55 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
261 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
273 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
229 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  21.49 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
264 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  27.93 
 
 
387 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 
271 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
624 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  19.87 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  19.87 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.32 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  24.17 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
266 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
236 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  26.15 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  33.01 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  33.01 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  23.87 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.55 
 
 
503 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35386  predicted protein  24.84 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  22.95 
 
 
278 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  32.04 
 
 
209 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  32 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  32.04 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
203 aa  45.1  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  26.02 
 
 
559 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  25.19 
 
 
280 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  25 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>