38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0703 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  45.23 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  31.05 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  32.62 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  31.72 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  30.57 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  30.41 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  25.38 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  29.9 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  24.53 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  28.43 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  32.73 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  32.26 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  24.76 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  31.11 
 
 		 1287 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.21 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  27.74 
 
 		 342 aa  45.1  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.9 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  26.92 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.22 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.4 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.27 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  24.52 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.36 
 
 		 256 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  23.35 
 
 		 210 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  29.46 
 
 		 1274 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.05 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>