35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0144 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  98.61 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  62.68 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  54.81 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  62.42 
 
 		 166 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  33.67 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  34.47 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  28.78 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  25.71 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  22.71 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  27.23 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  30.41 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  30.26 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  26.54 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  22.99 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  29.52 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  28.16 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.62 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 302 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  33.94 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>