29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0701 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  39.3 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  26.13 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  29.74 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  33.67 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  33.67 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  31.07 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  29.8 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  28.29 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  23.94 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  29.03 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  26.29 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.7 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  24.35 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  23.44 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  30.7 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.79 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.39 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.21 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 440 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 254 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>