116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0648 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  31.98 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  32.98 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  34.78 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  34.47 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  31.13 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  32.02 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  31.72 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  36.65 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  22.6 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  29.58 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  29.26 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  29.8 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  23.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  42.71 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  25.49 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.03 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  28.73 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  24.24 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  23.85 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.82 
 
 		 1119 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.45 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  33.63 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  33.63 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.67 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.77 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 284 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 286 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  25.2 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  25.74 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  25.74 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 298 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  43.55 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 252 aa  45.1  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  29.21 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  34.34 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  25.74 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003296  RS00376  hypothetical protein  35.21 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.985484 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  31.31 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  34.75 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.31 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  31.4 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43688  predicted protein  39.51 
 
 		 378 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.65 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  37.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  39.47 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5826  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 366 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.790939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  30.3 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  33.93 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  47.83 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  36 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  27.36 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.44 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  27.17 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  29.73 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  34.07 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 624 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  34.07 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>