26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4403 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 
218 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  52.45 
 
 
215 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  54.81 
 
 
216 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  53.85 
 
 
216 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  60.26 
 
 
166 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  26.19 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  28.97 
 
 
210 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  25.84 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  31.13 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  31.07 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  28.44 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  28.43 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  26.07 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  25.6 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  31.65 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  27.36 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  22.38 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  26.76 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  37.66 
 
 
254 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.18 
 
 
282 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
218 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>