More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0204 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  41.29 
 
 
209 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
209 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  43 
 
 
219 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  42.08 
 
 
210 aa  165  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  38.24 
 
 
218 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  40.2 
 
 
215 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  41.21 
 
 
204 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  42.23 
 
 
216 aa  158  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  41.06 
 
 
218 aa  153  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.14 
 
 
208 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  38.12 
 
 
209 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  36.1 
 
 
218 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  37.86 
 
 
214 aa  136  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  38.61 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  36.14 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  37.02 
 
 
229 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  32.49 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  29.79 
 
 
258 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  31.68 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.01 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  27.72 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  31.15 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  27.98 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  27.92 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  25.57 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  27.4 
 
 
305 aa  67  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.71 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  25.54 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.71 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  22.7 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  28.77 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  28.77 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  28.77 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  28.77 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  28.77 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.27 
 
 
269 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.57 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 
308 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
333 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
304 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
340 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  24.02 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
348 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  25.13 
 
 
312 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 
283 aa  61.6  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
249 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.1 
 
 
780 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
293 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.41 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  24.55 
 
 
335 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  22.86 
 
 
342 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.41 
 
 
395 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.29 
 
 
865 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  22.3 
 
 
354 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  22.3 
 
 
349 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  32.82 
 
 
653 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  23.3 
 
 
307 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
246 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  22.41 
 
 
259 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  21.86 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.31 
 
 
278 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  23.71 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  21.08 
 
 
307 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
307 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.84 
 
 
247 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
254 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  20.14 
 
 
328 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.08 
 
 
254 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  24.69 
 
 
240 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
269 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.91 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.91 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
274 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  23.73 
 
 
305 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  30.43 
 
 
580 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  24.8 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
349 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.51 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  30 
 
 
261 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
250 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>