More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2029 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  100 
 
 
215 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  48.77 
 
 
209 aa  184  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  40.2 
 
 
203 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  42.93 
 
 
210 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
218 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  40.91 
 
 
204 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  39 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  38.27 
 
 
218 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  41.71 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  40.2 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  35.38 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  38.24 
 
 
200 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  32.65 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
218 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  33.99 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  33 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  36.41 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
207 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  28.97 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.47 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  29.57 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  27.13 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.68 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03717  SAM-dependent methyltransferase (Eurofung)  26.97 
 
 
259 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0172981  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
349 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.54 
 
 
335 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.09 
 
 
305 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
341 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.47 
 
 
305 aa  62.4  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
339 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  28.25 
 
 
306 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  29.24 
 
 
341 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  27.59 
 
 
341 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
327 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
309 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
340 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.09 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  25.93 
 
 
310 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
341 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
254 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  25.14 
 
 
328 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
341 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  27.07 
 
 
210 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  29.63 
 
 
194 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
254 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
341 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
293 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  25.27 
 
 
305 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  32.43 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  25.81 
 
 
307 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  26.11 
 
 
354 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  26.11 
 
 
349 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
334 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
258 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
304 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  25.53 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
337 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  28.89 
 
 
249 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1019  Methyltransferase type 12  27.98 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  29.66 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  28.15 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  25.62 
 
 
342 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.44 
 
 
155 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  31.91 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
417 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.98 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.98 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.49 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  28.86 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
337 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.98 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.98 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  30 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>