46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1019 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1019  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  27.98 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  22.28 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  29.53 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 586 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7298  hypothetical protein  26 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  24.49 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 267 aa  45.1  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 585 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.63 
 
 		 2012 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  23.73 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  21.77 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  28.72 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  23.76 
 
 		 335 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 259 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 201 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.76 
 
 		 325 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  23.58 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  23.93 
 
 		 575 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 186 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  19.85 
 
 		 307 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  21.85 
 
 		 328 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  25.16 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>