156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0260 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  40.23 
 
 
265 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  23.35 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  31.65 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.53 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  37.8 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1763  hypothetical protein  37.65 
 
 
109 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.013046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  20.98 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  25.17 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  23.83 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  21.5 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  26.83 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  28.46 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  30.59 
 
 
323 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  32.59 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  31.78 
 
 
245 aa  52  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  33.7 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  28.24 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  27.47 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.4 
 
 
503 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  34.18 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  31.67 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  30.16 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
1561 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  35.37 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.94 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  24.55 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  22.38 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  35.35 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  25.81 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  20 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  22.38 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  26.12 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  18.89 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  34.55 
 
 
278 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
208 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  29.41 
 
 
278 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  27.47 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.44 
 
 
672 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  30.86 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  47.06 
 
 
291 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  30.34 
 
 
286 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  22.38 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  27 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
1509 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  23.15 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  35.9 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  18.94 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.95 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  31.17 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1505  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
308 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194787  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  31.17 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12968  hypothetical protein  27.17 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2221  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
314 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
572 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
207 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
282 aa  45.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.81 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  37.25 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1019  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0120  Methyltransferase type 12  30.09 
 
 
619 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  28.85 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  39.34 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  23.16 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  33.02 
 
 
783 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  27.83 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
996 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  23.64 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  36.67 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  22.62 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  27.05 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  33.73 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>