114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1037 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  100 
 
 
256 aa  521  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  31.28 
 
 
277 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  31.28 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  30.84 
 
 
273 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  39.87 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  33.55 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  27.11 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.18 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  37.38 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  29.27 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  26.77 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.17 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  31.55 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  28.5 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  27.67 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  33.61 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.13 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  40 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  32.39 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.45 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  26.07 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  29.49 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  32.14 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  25.58 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  26.88 
 
 
283 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  29.7 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  36.63 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  29.52 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  28.81 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  30.26 
 
 
302 aa  55.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3103  Methyltransferase type 12  32.46 
 
 
275 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00714601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25.6 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  24.4 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  31.01 
 
 
299 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  33 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  30.38 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  29.09 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  25.37 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  42.31 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  31.19 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  43.28 
 
 
180 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.45 
 
 
323 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  26.01 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  34.09 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.58 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  33.33 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
223 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  24.43 
 
 
284 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  26.24 
 
 
219 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  29.55 
 
 
200 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 
277 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  35 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  39.66 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  26.39 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  33.68 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  27.05 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1604  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.654755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
189 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.85 
 
 
263 aa  45.4  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1763  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.013046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
1561 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  26 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.46 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.9 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.17 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  36.54 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
991 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  29.93 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  35.82 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  26.67 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  36.54 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  27.45 
 
 
400 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.01 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>