134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01744 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  25.18 
 
 
267 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  23.35 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1763  hypothetical protein  48 
 
 
109 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.013046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.09 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.83 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30.56 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  26.29 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  25.76 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
301 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1810  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.91 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
457 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  32 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.39 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  23.4 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  26.03 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  24.46 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.86 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.56 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.86 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  22.22 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.37 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  22.62 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2836  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.5 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  28.68 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  23.53 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.84 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  29.57 
 
 
244 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.37 
 
 
251 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  23.85 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  29.63 
 
 
783 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.69 
 
 
248 aa  46.2  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
223 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  27.42 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.63 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  25.44 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.72 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  27.36 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6235  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  31.68 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.06 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1604  Methyltransferase type 12  23.27 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.654755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  22.66 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.3 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.35 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  21.28 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.43 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.3 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.3 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.3 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  22.97 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  28.57 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.03 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  24.19 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
196 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>