More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4205 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.22 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  43.78 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1810  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  27.13 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  22.37 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  25.99 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 1106 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  35.24 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 637 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1505  methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194787  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 429 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 638 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.81 
 
 		 200 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.07 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  21.09 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 207 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.06 
 
 		 198 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.55 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.73 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.31 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.22 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  21.74 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.17 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.87 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.15 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  30 
 
 		 575 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.31 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.41 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.11 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  38 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.69 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 241 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.12 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 221 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 252 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  28.26 
 
 		 261 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.58 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>