More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0740 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  94.12 
 
 
249 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  84.16 
 
 
249 aa  390  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  80.45 
 
 
249 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  81 
 
 
249 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  77.73 
 
 
249 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  76.82 
 
 
249 aa  350  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  78.64 
 
 
249 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  78.18 
 
 
249 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  73.64 
 
 
252 aa  341  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  77.73 
 
 
249 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  37.33 
 
 
261 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  39.3 
 
 
267 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  37.44 
 
 
295 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  39.55 
 
 
261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  37.91 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  37.91 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  37.91 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  39.55 
 
 
261 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  37.91 
 
 
267 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  37.56 
 
 
284 aa  144  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  39.09 
 
 
261 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  36.28 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  37.44 
 
 
267 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  39.73 
 
 
268 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  39.07 
 
 
278 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  35.14 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  38.6 
 
 
261 aa  137  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  36.15 
 
 
258 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  36.87 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.35 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  36.87 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  38.36 
 
 
256 aa  134  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  38.46 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  37.67 
 
 
261 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  37.87 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  35.24 
 
 
260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  35.19 
 
 
271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  36.04 
 
 
254 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
257 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  35 
 
 
257 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
257 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  35 
 
 
257 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  31.8 
 
 
247 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  31.6 
 
 
259 aa  121  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  34.76 
 
 
261 aa  121  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  34.13 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  30.77 
 
 
263 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  31.88 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  42.28 
 
 
199 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  31.7 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  30.66 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  31.14 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  21.88 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.62 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.57 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.43 
 
 
237 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
244 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
248 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.25 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  25.43 
 
 
244 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.3 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.71 
 
 
263 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
262 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.64 
 
 
312 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  25.93 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>