168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0313 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  100 
 
 
257 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  79.38 
 
 
253 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  78.99 
 
 
259 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  64.59 
 
 
258 aa  350  8.999999999999999e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  43.03 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  42.29 
 
 
249 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  31.64 
 
 
257 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
254 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  31.25 
 
 
257 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  32.97 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  32.35 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  32.35 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  39.06 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  31.76 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.18 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.18 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.18 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  29.68 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  26.1 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  24.69 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.66 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  21.77 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4884  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.321775  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.98 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.32 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.67 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.55 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  33.04 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.84 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
279 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  23.79 
 
 
252 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  26.34 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.82 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.82 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
276 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  28.57 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  28.47 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  32.67 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0595  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.55 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.316982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.92 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  22.4 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  35.63 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.79 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.601937  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.02 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  22.09 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  22.75 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3929  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  50 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0998  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.36 
 
 
230 aa  47  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
280 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  28.36 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2642  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
390 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350923  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0620  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.033917  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20833  predicted protein  24.2 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>