More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1936 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  100 
 
 
213 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  63.94 
 
 
208 aa  275  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  49.76 
 
 
217 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  50.24 
 
 
209 aa  222  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  54.19 
 
 
207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  49.52 
 
 
219 aa  209  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  50.73 
 
 
207 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.63 
 
 
503 aa  184  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
210 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  44.71 
 
 
212 aa  175  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  43.26 
 
 
215 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  42.51 
 
 
218 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  46.71 
 
 
191 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  42.51 
 
 
212 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  38.42 
 
 
204 aa  135  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
229 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  39.25 
 
 
285 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  36.31 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  40 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  38.25 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
221 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.18 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.01 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.42 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.24 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
267 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 
241 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
252 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
305 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  33.94 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  30.46 
 
 
335 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.64 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0043  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.14 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.59 
 
 
345 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
265 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
256 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
307 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  35.04 
 
 
256 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
266 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.68 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.73 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
270 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
270 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
270 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  29.45 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.56 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
182 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  34.35 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  32.3 
 
 
629 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
320 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  30.3 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.5 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.44 
 
 
269 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.04 
 
 
310 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.89 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>