More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0221 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  100 
 
 
208 aa  434  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  46.38 
 
 
207 aa  203  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
219 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
291 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
319 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00656  Uncharacterized methyltransferase AN0656 (EC 2.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFM4]  27.07 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.529096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.14 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.14 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.08 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.26 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  25.18 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.45 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.23 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  31.16 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  30.25 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  25.93 
 
 
312 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 
234 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.33 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
250 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.89 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  31.73 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  24.02 
 
 
629 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.33 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  31.19 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  26.77 
 
 
283 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  26.77 
 
 
252 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  26.77 
 
 
252 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
265 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  30.37 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  26.8 
 
 
291 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  31.19 
 
 
251 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  30.46 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  34.29 
 
 
259 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.58 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.28 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  24.82 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30.28 
 
 
251 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  30.28 
 
 
251 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
266 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.75 
 
 
262 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
247 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  24.14 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.36 
 
 
241 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  25.9 
 
 
238 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
241 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
269 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31900  predicted protein  31.33 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.041967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.18 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
262 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  22.39 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
264 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  37.62 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.87 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  29 
 
 
315 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.93 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  29.71 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.06 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.58 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>