247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1401 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  100 
 
 		 270 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  54.21 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  49.8 
 
 		 245 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  46.18 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  48.77 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  48.39 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  52.09 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  49.4 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  50.79 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  47.03 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  45.95 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  49.77 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  44.13 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  53.7 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  46.76 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  31.25 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  30.86 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  37.56 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  30.31 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  30 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  28.17 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  29.25 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  30.4 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  27.95 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  22.48 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  28.91 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  28.91 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  28 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  28.91 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  25.81 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  21.69 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  21.4 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  26.05 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  33.18 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  21.4 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  25.7 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  24.88 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  31.02 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  21.4 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  30.05 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  33.14 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  25.7 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  27.03 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  33.18 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  31.65 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  24.89 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  29.95 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  27.98 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  30.22 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.54 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  29.38 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  37 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  22.12 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  32.37 
 
 		 414 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.88 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.61 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.34 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>