226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0120 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  55.22 
 
 
294 aa  217  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  49.02 
 
 
206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  51.47 
 
 
205 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  47.34 
 
 
223 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  48.76 
 
 
205 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  48.53 
 
 
206 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  50.25 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  39.71 
 
 
206 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  193  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  46.57 
 
 
207 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  46.53 
 
 
203 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  46.53 
 
 
203 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  46.53 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  46.57 
 
 
206 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  44.22 
 
 
207 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  46.67 
 
 
194 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  39.9 
 
 
210 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  48.66 
 
 
209 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.88 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  27.15 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
239 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.64 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
277 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.64 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
246 aa  52.4  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.97 
 
 
213 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
240 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
198 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.99 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  23.78 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  38.32 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
382 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  30.43 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  27.85 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  30.36 
 
 
265 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
269 aa  48.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  31.4 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
284 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  35.11 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  31.4 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
305 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.61 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
305 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.24 
 
 
277 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.49 
 
 
267 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
261 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  28.35 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  28.35 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.13 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  24.11 
 
 
258 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
348 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  31.78 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.13 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  31.87 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
457 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  33.04 
 
 
658 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  26.01 
 
 
401 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30 
 
 
265 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
282 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  42.17 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  22.06 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  38.95 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
269 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 
243 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
273 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
269 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>