57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1827 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0264  hypothetical protein  45.99 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0278  hypothetical protein  45.99 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0309  hypothetical protein  45.99 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0339  hypothetical protein  44.05 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0304  hypothetical protein  43.48 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0324  hypothetical protein  44.12 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0258  methyltransferase type 12  43.48 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3965  Methyltransferase type 12  41.75 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0635  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.690078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 854 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1379  hypothetical protein  30.17 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  30.3 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2252  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.821266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  25.41 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  62.16 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 2046 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  24.4 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  25.2 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  25.24 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  25.24 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  52.5 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  22.78 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  22.78 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  54.55 
 
 		 2796 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 733 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  24.42 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  21.77 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  21.77 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  21.77 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  21.77 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  23.84 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  22.14 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  21.77 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  52.63 
 
 		 1476 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.46 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.43 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.2 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48517  predicted protein  26.55 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  35 
 
 		 1632 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  24.32 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  24.63 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  43.48 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  24.68 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  23.57 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0239  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 595 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0299  hypothetical protein  38 
 
 		 171 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  24.68 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  28.57 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  27.73 
 
 		 205 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  43.9 
 
 		 916 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>