35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3965 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3965  Methyltransferase type 12  100 
 
 
206 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0324  hypothetical protein  43.3 
 
 
258 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  41.75 
 
 
295 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0278  hypothetical protein  38.83 
 
 
257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0264  hypothetical protein  38.83 
 
 
257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0339  hypothetical protein  38.35 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0309  hypothetical protein  38.83 
 
 
257 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0304  hypothetical protein  38.16 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0258  methyltransferase type 12  38.83 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0635  methyltransferase type 12  35.57 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.690078  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  38.07 
 
 
854 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1379  hypothetical protein  30.24 
 
 
393 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2252  Methyltransferase type 12  35.45 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.821266  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
2046 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  27.59 
 
 
288 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  22.9 
 
 
290 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  22.9 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  22.9 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  21.37 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  22.73 
 
 
290 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  21.55 
 
 
482 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
281 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
317 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3143  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
392 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.3 
 
 
394 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.93 
 
 
269 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 
394 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.93 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  22.64 
 
 
242 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  23.36 
 
 
394 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  23.36 
 
 
394 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>