31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1379 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1379  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  811    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
854 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0635  methyltransferase type 12  37.93 
 
 
233 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.690078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  30.17 
 
 
295 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0258  methyltransferase type 12  26.97 
 
 
258 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0264  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0278  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0309  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0304  hypothetical protein  28.39 
 
 
258 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0339  hypothetical protein  27.2 
 
 
257 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3965  Methyltransferase type 12  30.24 
 
 
206 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0324  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2252  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
238 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.821266  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  20.06 
 
 
2046 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  26.17 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  24.3 
 
 
290 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  24.3 
 
 
290 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  24.3 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  22.48 
 
 
203 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  23.58 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  24.69 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  26.36 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  22.89 
 
 
482 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.06 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  29.37 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  27.64 
 
 
201 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  30.34 
 
 
225 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2688  Methyltransferase type 12  26.4 
 
 
256 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
317 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>