More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3814 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  70.3 
 
 		 216 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  69.8 
 
 		 203 aa  294  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  53.2 
 
 		 205 aa  222  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  51.23 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  52.97 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  51.74 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  46.31 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  45.6 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  48.29 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  46.37 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  46.23 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  44.83 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  44.33 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.6 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  42.08 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  42.28 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.12 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  35.84 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.05 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  38.56 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  41.45 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.86 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  32.35 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.91 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  32.97 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  35.57 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 221 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  38.12 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31900  predicted protein  30.63 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.041967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  35.57 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  36.49 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  40.8 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.61 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.51 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  35.57 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  35.57 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4578  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.89 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30493  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4097  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.89 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4465  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.89 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.46 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  34.9 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.77 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.19 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  34.48 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  26.95 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  29.8 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5064  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.07 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.25 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01203  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.24 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  28.07 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.85 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.13 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.82 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.82 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50235  predicted protein  33.33 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.27 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.58 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.59 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>