More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0078 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  64.34 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  45.89 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  33.72 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.39 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  27.31 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  23.31 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.1 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  23.22 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  22.93 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  22.47 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  22.47 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  22.18 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.07 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  22.56 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  22.56 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  22.56 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  22.56 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  22.56 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  28.28 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.45 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.87 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  33.52 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  26.12 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  27.67 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  22.38 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  29.27 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  22.79 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  21.86 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  22.79 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  24.47 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  26.78 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.07 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  23.15 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.97 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  31.2 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  20 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  34.88 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 637 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.54 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  48.44 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 675 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.06 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  42.65 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.25 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  30.72 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  41.77 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>