20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2089 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2089  methyltransferase type 12  100 
 
 
315 aa  620  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0161  hypothetical protein  29.32 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.05 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.6 
 
 
200 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  32.48 
 
 
273 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.7 
 
 
259 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
200 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  32.82 
 
 
210 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  32.82 
 
 
210 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.9 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
200 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
200 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  37.97 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
214 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
227 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  33.06 
 
 
476 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>