150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1052 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  100 
 
 
265 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
991 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  28.8 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  24.35 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  24.55 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  23.17 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  25.16 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  23.01 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.48 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  25 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  24.34 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.84 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.85 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  27.68 
 
 
129 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  24.34 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  25.71 
 
 
219 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  25.71 
 
 
219 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.44 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  25.71 
 
 
219 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  25.71 
 
 
219 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  25.27 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.33 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  23.68 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.51 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4300  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  23.98 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.08 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  40 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.11 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.48 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.16 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.51 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  26.72 
 
 
258 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  22.86 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 
232 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.37 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2769  methyltransferase type 11  20.83 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  26.45 
 
 
621 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
197 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  23.17 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  23.17 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.37 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  23.28 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  26.57 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
996 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  22.58 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  23.78 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.38 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.38 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  21.11 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.06 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  24.26 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  34.78 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.16 
 
 
541 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.72 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  33.7 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.15 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.43 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.9 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  25.38 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  20.43 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.43 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  22.1 
 
 
218 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  24.58 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  23.02 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  30.56 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.42 
 
 
356 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.2 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.32 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>