74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4010 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 226 aa  471  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  67.83 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  64.16 
 
 		 219 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  65.33 
 
 		 218 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  59.56 
 
 		 218 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  59.11 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  60 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  59.56 
 
 		 218 aa  288  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  59.56 
 
 		 218 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  59.73 
 
 		 219 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  58.67 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  58.67 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  60 
 
 		 218 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  56.89 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  58.67 
 
 		 218 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  54.22 
 
 		 218 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  44.69 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  43.81 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  43.56 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  43.24 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  43.3 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  43.11 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  41.96 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  43.24 
 
 		 215 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  41.96 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  41.78 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  40 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  39.82 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  38.67 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  39.38 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  39.65 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.59 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  39.17 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  37.79 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  34.98 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  41.34 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  42.13 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  34.38 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  37.73 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  36.65 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  36.65 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  36.52 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  34.09 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  33.18 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  34.67 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  36.18 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  37.78 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  34.11 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  32.16 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  38.46 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  35.14 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  32.42 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  27.19 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  22.89 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  28.85 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  21.88 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  23.15 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  22.63 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  22.6 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  24.88 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  24.88 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  23.36 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  24.88 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  24.88 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  25.29 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  25.29 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  25.29 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  23.36 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  25.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  24.71 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  36.92 
 
 		 208 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  36.84 
 
 		 208 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>