202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2586 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  96.57 
 
 		 204 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  89.85 
 
 		 200 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  88.89 
 
 		 201 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  88.89 
 
 		 201 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  87.88 
 
 		 201 aa  324  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  85.28 
 
 		 201 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  67.18 
 
 		 201 aa  259  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  63.44 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  63.44 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  62.9 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  62.9 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  62.9 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  62.9 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  52.31 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  52.82 
 
 		 196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  52.55 
 
 		 196 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  48.22 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 551 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  39.6 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.21 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  25.63 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  37 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.62 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  37.84 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 575 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  29.05 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.48 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  33.64 
 
 		 535 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 1287 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  23.32 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 364 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  25.16 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  36.94 
 
 		 522 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  30 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.03 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.04 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  30.77 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 440 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.71 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  29.78 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.81 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  29.81 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 540 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  31.39 
 
 		 410 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  23.12 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.82 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>