More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4049 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 289 aa  604  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  53.17 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  50.17 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  51.74 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  52.09 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 122 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  45.31 
 
 		 133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 		 131 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  42.86 
 
 		 1077 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  46.79 
 
 		 142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.63 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  42.98 
 
 		 124 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  45.08 
 
 		 149 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 130 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  33.14 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 126 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 		 130 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  39.5 
 
 		 120 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.06 
 
 		 127 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  41.46 
 
 		 122 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 125 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  40.83 
 
 		 131 aa  99  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  38.6 
 
 		 1418 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.74 
 
 		 126 aa  97.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 		 125 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  37.1 
 
 		 138 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  46.07 
 
 		 109 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  35.85 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  34.51 
 
 		 166 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  35.4 
 
 		 162 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  28.74 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  35.78 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  33.62 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  35.43 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  28.75 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  40.7 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 162 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 165 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  38.46 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  35.65 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  24 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 141 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  32.29 
 
 		 160 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  32.46 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  38.37 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0925  histidine triad (HIT) protein  32.23 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.220033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  31.53 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  41.03 
 
 		 759 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 		 164 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  28.8 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  32.29 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  29.03 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  31.52 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  29.17 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  38.04 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  28.83 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  37.93 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  39.56 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  26.96 
 
 		 165 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  35.11 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  48 
 
 		 1348 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  26.96 
 
 		 165 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  31.91 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 		 164 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.17 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>