261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2539 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  52.58 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  50.52 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  53.12 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  48.98 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  46.94 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  47.21 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  45.13 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  44.5 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  44.5 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  44.85 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  37.79 
 
 		 1287 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  39.88 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  36.81 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  34.43 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  33.88 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  33.88 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  31.08 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  29.21 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  35.93 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.16 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  34.57 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  34.21 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.13 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  32.52 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  37.61 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.76 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  32.7 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  32.7 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  32.7 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  32.7 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  32.7 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  32.7 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  29.95 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 575 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 551 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.19 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  31.07 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 		 1561 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.68 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.56 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  36.61 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  26.42 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.47 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.45 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.07 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1586  hypothetical protein  38.52 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.728643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  30 
 
 		 442 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.1 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  36.89 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.68 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1503  hypothetical protein  37.7 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  34.65 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  37 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.66 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.66 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  30 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>