288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0330 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  466  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  28.3 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  31.29 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  29.76 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  30.56 
 
 
280 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  25.17 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  25.17 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  25.17 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.1 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28 
 
 
865 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  32.99 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  26.58 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  30.51 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  28.7 
 
 
631 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  24.5 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  26.92 
 
 
286 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  24 
 
 
197 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.51 
 
 
256 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.22 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  27.22 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  27.22 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  29.41 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  24 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  27.22 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  29.41 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  24 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.75 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.94 
 
 
1287 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.43 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  24.5 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  28.85 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.12 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2270  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 
263 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
1015 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.41 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 
295 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  29.27 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 
295 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 
295 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  29.82 
 
 
298 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  29.81 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  26.17 
 
 
580 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
305 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  25 
 
 
315 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  27.14 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
202 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 
250 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
1106 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 
192 aa  48.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
291 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  26.19 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  27.12 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 
442 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  23.38 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  23.33 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  32.48 
 
 
464 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  32.8 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.48 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.71 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  27.12 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  27.12 
 
 
236 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  25.17 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.48 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  27.12 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.89 
 
 
213 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  27.45 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  27.12 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.15 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>