43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2265 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  52.86 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  52.86 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  51.9 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  50.68 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  47.09 
 
 		 585 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  44.14 
 
 		 575 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  41.59 
 
 		 586 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 560 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  47.65 
 
 		 522 aa  148  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  45.4 
 
 		 535 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  41.2 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  37.44 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  37.95 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  30.52 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  36.41 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  31.67 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 551 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  22.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 349 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  27.2 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.03 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  24.7 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  21.29 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4849  methyltransferase type 12  31.72 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  30.95 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.87 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  27.64 
 
 		 355 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  27.33 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 213 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 262 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  27.13 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  27.13 
 
 		 236 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  27.13 
 
 		 236 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  27.13 
 
 		 236 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  27.13 
 
 		 236 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>