46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2936 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2936  Methyltransferase type 11  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1288  Methyltransferase type 12  93.41 
 
 
183 aa  350  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63196e-27 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  29.5 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  31.71 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  30.23 
 
 
287 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  31.48 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.51 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  27.61 
 
 
295 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.09 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.09 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  27.61 
 
 
295 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  27.61 
 
 
295 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  35.14 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
246 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  29.51 
 
 
292 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
251 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
236 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  29.69 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  30.08 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  29.27 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  29.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  29.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
236 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  29.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 
252 aa  42.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.17 
 
 
243 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
254 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  28.46 
 
 
197 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  28.46 
 
 
197 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.33 
 
 
222 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.17 
 
 
236 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.17 
 
 
190 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  28.46 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  28.46 
 
 
197 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  28.46 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
221 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
203 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  27.64 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  27.64 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  27.64 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.64 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>