186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0919 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
646 aa  1316    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  53.7 
 
 
1635 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  61.22 
 
 
272 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  61.22 
 
 
272 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  54.09 
 
 
396 aa  291  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  48.05 
 
 
442 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  49.33 
 
 
436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  41.82 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  44.49 
 
 
306 aa  224  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  35.14 
 
 
373 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
477 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  43.02 
 
 
351 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  42.2 
 
 
376 aa  125  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  33.88 
 
 
1085 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  28.96 
 
 
383 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
995 aa  65.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.11 
 
 
345 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
211 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
255 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
256 aa  60.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  35 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
256 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  23.5 
 
 
226 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  33.09 
 
 
488 aa  57.4  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
210 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
328 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
328 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
328 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  33.62 
 
 
308 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  35.24 
 
 
327 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
222 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
237 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  30.56 
 
 
783 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.69 
 
 
245 aa  54.7  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
239 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
332 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
341 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
209 aa  53.9  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  42.86 
 
 
201 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  34.95 
 
 
249 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
240 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
331 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  32.61 
 
 
185 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 
264 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
282 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.12 
 
 
243 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30 
 
 
303 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
244 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
317 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
324 aa  51.6  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
263 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
274 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
220 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  29.81 
 
 
290 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
457 aa  50.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  32 
 
 
336 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  30.47 
 
 
274 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  28.57 
 
 
459 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.56 
 
 
672 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
208 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.5 
 
 
258 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
320 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  30.83 
 
 
191 aa  49.7  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
207 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
325 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
259 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 
237 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  32.98 
 
 
229 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
266 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
232 aa  48.5  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3279  hypothetical protein  27.82 
 
 
190 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  25.9 
 
 
239 aa  48.1  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
310 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  32.26 
 
 
304 aa  47.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
255 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 
291 aa  47.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
229 aa  47.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  27.92 
 
 
236 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
244 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.79 
 
 
297 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  28 
 
 
233 aa  47.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  28.95 
 
 
323 aa  47.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
247 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  37.5 
 
 
229 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  37.5 
 
 
229 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
266 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
383 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  39.22 
 
 
227 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  28 
 
 
456 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  32.61 
 
 
222 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  37.5 
 
 
229 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf653  massive surface protein MspH  26.32 
 
 
2438 aa  47  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
262 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  34.85 
 
 
195 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.38 
 
 
262 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>