237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2979 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  61.22 
 
 		 646 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  61.63 
 
 		 1635 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  61.32 
 
 		 442 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  62.96 
 
 		 442 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  55.43 
 
 		 396 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  54.07 
 
 		 436 aa  285  8e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  45.9 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 477 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  30.84 
 
 		 373 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  31.78 
 
 		 417 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  37.85 
 
 		 376 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1085 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  33.87 
 
 		 383 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.78 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 995 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  41.75 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  26.9 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  35 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.31 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  33.04 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.98 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 1106 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 196 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1094 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.23 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  39 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30.48 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 310 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  28.97 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.06 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.22 
 
 		 672 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  35.14 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  30.19 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.29 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  31.15 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  28.4 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  43.1 
 
 		 195 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  32.79 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  41.38 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  45.61 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 706 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  26.19 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  26.19 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  31.67 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.63 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  29.7 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  26.19 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  31 
 
 		 401 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  29.7 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.24 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.26 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  33.86 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>