172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3058 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  59.79 
 
 
206 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  58.16 
 
 
199 aa  254  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  59.31 
 
 
206 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  60.82 
 
 
206 aa  253  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  55.67 
 
 
206 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  57.58 
 
 
206 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  58.25 
 
 
212 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  58.25 
 
 
206 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  58.79 
 
 
200 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  57.64 
 
 
206 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  57.22 
 
 
206 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  57.22 
 
 
206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  55.28 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  56.12 
 
 
196 aa  238  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  51.53 
 
 
198 aa  221  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  50.25 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  49.5 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  47.8 
 
 
206 aa  205  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  49.25 
 
 
201 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  49.25 
 
 
201 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  46.04 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  44.78 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  43.72 
 
 
200 aa  191  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  44.9 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  45.92 
 
 
197 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  46.11 
 
 
215 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  47.96 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  45.6 
 
 
211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  45.27 
 
 
209 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  45.08 
 
 
211 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  43.01 
 
 
206 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  43.37 
 
 
202 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  43.37 
 
 
202 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  43.37 
 
 
202 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  43.37 
 
 
202 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  43.37 
 
 
202 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  45.05 
 
 
229 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  42.86 
 
 
202 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  45.05 
 
 
229 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  43.65 
 
 
203 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  45.27 
 
 
229 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  43.37 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  45.59 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  42.86 
 
 
202 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 
242 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  44.1 
 
 
196 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  42.86 
 
 
202 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  45.41 
 
 
193 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  45.55 
 
 
195 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  45.41 
 
 
195 aa  168  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  44.21 
 
 
194 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  45.13 
 
 
202 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  43.01 
 
 
194 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  42.27 
 
 
203 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  43.08 
 
 
204 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  43.23 
 
 
194 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  45.26 
 
 
202 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  43.23 
 
 
194 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  42.64 
 
 
202 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  42.13 
 
 
202 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  43.3 
 
 
203 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  47.59 
 
 
210 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  44.16 
 
 
220 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  40.82 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  43.07 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  42.08 
 
 
217 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  38.38 
 
 
211 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  41.09 
 
 
214 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  41.58 
 
 
220 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  42.64 
 
 
221 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  39.5 
 
 
229 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  40.69 
 
 
222 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  40.39 
 
 
230 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  40 
 
 
210 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  38.92 
 
 
222 aa  154  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  40.39 
 
 
231 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  40.39 
 
 
231 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  44.17 
 
 
195 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  40.7 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  41.75 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  40.91 
 
 
201 aa  151  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  39.39 
 
 
222 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  43.88 
 
 
194 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  37.56 
 
 
229 aa  147  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  30.69 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.64 
 
 
249 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
274 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  30.09 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  30.7 
 
 
185 aa  52  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  25.53 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>