More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5630 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5630  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 243 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.502531  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.5 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.23 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.85 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  26.88 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  25.35 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.81 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  28.65 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 341 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.06 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  24.43 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.09 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  29.77 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  25 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.78 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  30.94 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  24.43 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  24.43 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  24.43 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.38 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  23.86 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.69 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  24.65 
 
 		 663 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  26.5 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  25 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  27.03 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.46 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.93 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  25.14 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  26.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>