More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0455 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
260 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
259 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0837  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.702425  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.81 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4208  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3108  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
377 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
429 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  50 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  46.88 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
457 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  44.66 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  40.31 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  27.81 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  36.29 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  32.74 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0306  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
165 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.78 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
239 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.88 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.88 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  32.29 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  29.25 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.08 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  33.04 
 
 
204 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  37.38 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  40.66 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.16 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.16 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.16 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.16 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  36 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  42.05 
 
 
271 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  31.67 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
165 aa  55.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
250 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
189 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  31.15 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  26.4 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.39 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.36 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.27 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.61 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.68 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  43.37 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.17 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  37 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  31.63 
 
 
194 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
319 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  31.63 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.36 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  29.84 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.91 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
225 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>