More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1390 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  31.78 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  28.83 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  30 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.61 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  32 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  35.95 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  29.94 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  29.07 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 1523 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  32.48 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  33.51 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  32.79 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  32.79 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  32.79 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  35.19 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  29.71 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.67 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  29.71 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  29.71 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  32.3 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.04 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  25.61 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  29.31 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 1162 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.55 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.18 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  24.72 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  29.3 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  38.14 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.2 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  39.6 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.74 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.4 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.6 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  25.62 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  28.81 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  38 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.5 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 2112 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.79 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.92 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>