More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0952 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 944 aa  888    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 925 aa  712    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1146 aa  2400    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 949 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 923 aa  708    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 921 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 922 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 936 aa  727    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 969 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 954 aa  948    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 906 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 936 aa  497  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 838 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 854 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 858 aa  481  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 833 aa  478  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  37.5 
 
 		 879 aa  474  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 971 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 971 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 971 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 840 aa  463  1e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 934 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 833 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 949 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 951 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 835 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 949 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 968 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 969 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 978 aa  432  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 984 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 987 aa  429  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 950 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 952 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  37.1 
 
 		 994 aa  426  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 978 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 963 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 819 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 984 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 954 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 952 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 990 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 982 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 958 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 968 aa  399  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 1016 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 985 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 1064 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 851 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 856 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 856 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 904 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 865 aa  373  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 904 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 867 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 862 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 859 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 862 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 854 aa  364  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 858 aa  363  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 872 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 875 aa  362  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 866 aa  356  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 859 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 875 aa  352  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 859 aa  352  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 875 aa  350  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 859 aa  350  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 859 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 870 aa  349  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 864 aa  347  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 864 aa  347  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 857 aa  346  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 884 aa  346  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 857 aa  345  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 805 aa  344  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 859 aa  343  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 863 aa  343  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 872 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 859 aa  341  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 859 aa  340  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 859 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 868 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 864 aa  340  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 874 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 874 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2958  leucyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 860 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0232  leucyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 890 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 863 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 874 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 860 aa  337  5.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 872 aa  337  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 887 aa  337  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 805 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 944 aa  337  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0990  leucyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 858 aa  337  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300602  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 861 aa  337  1e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 862 aa  337  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 864 aa  336  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>