20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0927 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0927  type III restriction system methylase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.714922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0748  type III restriction system methylase  75.83 
 
 		 214 aa  350  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0195  type III restriction system methylase  74.53 
 
 		 213 aa  339  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2423  hypothetical protein  72.82 
 
 		 218 aa  327  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2229  type III restriction system methylase  47.22 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00005113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0903  type III restriction system methylase  43.32 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0306366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1331  type II restriction-modification system modification subunit  42.68 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000710469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1587  type II restriction-modification system modification subunit  37.2 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  56.86 
 
 		 1093 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.28 
 
 		 526 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  49.06 
 
 		 746 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  32.22 
 
 		 508 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  35.51 
 
 		 926 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  35.71 
 
 		 1219 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  36.45 
 
 		 928 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  34.58 
 
 		 928 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1339 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  34.95 
 
 		 1459 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1022 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  29.59 
 
 		 489 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>