19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2229 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2229  type III restriction system methylase  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00005113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0903  type III restriction system methylase  63.26 
 
 
215 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0306366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0927  type III restriction system methylase  47.22 
 
 
213 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.714922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0195  type III restriction system methylase  47.89 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0748  type III restriction system methylase  47.39 
 
 
214 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2423  hypothetical protein  42.72 
 
 
218 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351192  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1331  type II restriction-modification system modification subunit  37.86 
 
 
224 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000710469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1587  type II restriction-modification system modification subunit  39.47 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  31.73 
 
 
493 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  37.65 
 
 
846 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  29.35 
 
 
554 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  43.48 
 
 
1093 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 
834 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.85 
 
 
792 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.06 
 
 
526 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  27.72 
 
 
508 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 
838 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.18 
 
 
703 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  31.71 
 
 
489 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>