24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0750 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 		 1364 aa  2815    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  51.09 
 
 		 1359 aa  1284    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1589  Eco57I restriction endonuclease  42.86 
 
 		 351 aa  299  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  40.72 
 
 		 1324 aa  275  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0513  Eco57I restriction endonuclease  42.32 
 
 		 341 aa  239  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.611279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0745  hypothetical protein  24.09 
 
 		 852 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.947615  normal  0.0888833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0923  type III restriction system endonuclease, putative  26.97 
 
 		 850 aa  157  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297782  normal  0.710941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2226  putative uncharacterized restriction enzyme  24.64 
 
 		 837 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000214566  decreased coverage  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0905  putative restriction enzyme  25.22 
 
 		 853 aa  157  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2421  hypothetical protein  24.26 
 
 		 844 aa  155  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0198  type III restriction system endonuclease, putative  24.21 
 
 		 848 aa  143  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.49 
 
 		 526 aa  140  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1453  Eco57I restriction endonuclease  28.89 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1330  superfamily II DNA/RNA helicase  28.1 
 
 		 1462 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.55 
 
 		 531 aa  122  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.11 
 
 		 530 aa  115  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1588  type III restriction enzyme, res subunit  24.95 
 
 		 1094 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1677  type III restriction protein res subunit  23 
 
 		 1110 aa  106  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0514  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1108 aa  93.2  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  35.62 
 
 		 562 aa  91.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.67 
 
 		 514 aa  89  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  33.08 
 
 		 139 aa  73.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1676  Eco57I restriction endonuclease  24.86 
 
 		 665 aa  59.3  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0926  Eco57I restriction endonuclease  23.3 
 
 		 321 aa  55.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.538577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>