19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0645 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  343  6e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  69.81 
 
 		 286 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  62.04 
 
 		 278 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  56.31 
 
 		 259 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  48.67 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  54.55 
 
 		 259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  55.95 
 
 		 261 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  49.45 
 
 		 260 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  55.77 
 
 		 526 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  50.82 
 
 		 562 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  46.67 
 
 		 530 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  37.5 
 
 		 275 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  51.92 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  47.06 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.1 
 
 		 514 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  37.1 
 
 		 1324 aa  43.9  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0157  phosphogluconate dehydratase  22.84 
 
 		 604 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  35.48 
 
 		 1364 aa  42.4  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>